Dal 1993 il museo ha sede a Nervi, nella settecentesca villa Grimaldi Fassio, acquistata dal Comune di Genova nel 1979.
Le importanti collezioni di arte otto-novecentesca dei fratelli Frugone comprendono dipinti, sculture e disegni di artisti italiani e stranieri attivi tra la seconda metà dell’Ottocento e il primo Novecento.
Tra gli artisti rappresentati Mosé Bianchi, Leonardo Bistolfi, Giovanni Boldini, Guglielmo Ciardi, Luigi Conconi,Tranquillo Cremona, Lorenzo Delleani, Giuseppe De Nittis, Giovanni Fattori, Antonio Fontanesi, Pietro Fragiacomo, Emilio Gola, Giacomo Grosso, Antonio Mancini, Francesco Messina Francesco, Francesco Paolo Michetti, Alessandro Milesi, Richard Miller, Giuseppe e Filippo Palizzi, Edoardo Rubino, Giovanni Segantini, Telemaco Signorini, Joaquin Sorolla y Bastida, Ettore Tito, Paolo Troubetzkoy.