La collezione di scultura del Museo annovera alcune importanti testimonianze sul primo cristianesimo a Genova, come la Lapide di Santolo (V secolo) mentre proviene dalla Chiesa di S. Maria delle Vigne il Concio con angelo (1160 circa), scolpito dalla mano di un grande artista d’oltralpe. Eccezionale testimonianza della scultura monumentale trecentesca è la Tomba di Luca Fieschi (XIV secolo), mentre illustrano il barocco genovese le scenografiche statue-reliquiario con San Rocco e San Sebastiano di realizzate da Anton Maria Maragliano, straordinario artista particolarmente abile nel creare movimentate macchine processionali per le confraternite e le chiese genovesi.