Il Museo ha anche una funzione didattica rivolta alle scuole con incontri e mostre specifiche in ricorrenze alla giornata della memoria. Lo spazio all'interno del Museo è articolato in maniera dinamica e modulare per consentire alla struttura di ospitare varie e diverse proposte culturali e artistiche e di contenere, in modo permanente, oggetti che rimandano alla storia e alla cultura degli ebrei genovesi.